Unabhängig von der Sorte sollte jede Schokolade an einem kühlen und trockenen Ort mit niedriger Luftfeuchtigkeit und vor direkter Sonneneinstrahlung geschützt gelagert werden. Am besten ist es, sie in einem luftdicht verschlossenen Behälter zu lagern, denn, wie ElendiTheTall sagte, wird die darin enthaltene Kakaobutter Aromen absorbieren.
Dunkle Schokolade hält jahrelang. Milchschokolade und weiße Schokolade halten aufgrund ihres Milchgehalts viel kürzer (einige Monate).
Bei unsachgemäßer Lagerung entwickelt Schokolade eine Blüte, die sich als weiße oder graue Streifen oder Flecken auf der Oberfläche zeigt. Die Flecken oder Schlieren sind Kakaobutterfettabscheidung und ein Zeichen dafür, dass die Schokolade ihr Temperament verloren hat. Diese Art von Schokolade eignet sich nach wie vor für alle Anwendungen, bei denen die Schokolade vollständig geschmolzen wird (meist Backen). Sie kann sogar als Basisschokolade (ohne Kerne) für die Temperierung mit der Impfmethode verwendet werden, aber sie sollte nicht für andere Süßwarenherstellung verwendet werden.